Stan czystości wód powierzchniowych województwa oceniany jest corocznie w oparciu o analityczne pomiary kontrolne realizowane w ramach monitoringu środowiska dla wód powierzchniowych płynących (sieć podstawowa i regionalna) oraz zbiorników zaporowych (sieć regionalna). W związku ze zmianą granic naszego województwa w roku 1999 rozszerzono dotychczasowe badania objęte monitoringiem regionalnym o rzeki:Koprzywiankę, Opatówkę oraz ujściowe odcinki Wschodniej i Czarnej Staszowskiej. Do monitoringu podstawowego włączono dodatkowo jeden punkt pomiarowy - Ciemiętniki na Czarnej Włoszczowskiej. Jednocześnie odstąpiono od badań Nidzicy w ppk Małoszów i Wisły w ppk Koszyce, które znalazły się na obszarze woj. małopolskiego. Ocenę wykonano dla wód powierzchniowych objętych obecnymi granicami województwa świętokrzyskiego na podstawie badań własnych, które prowadziło Laboratorium Wojewódzkiego Inspektoratu Ochrony Środowiska w Kielcach legitymujące się CERTYFIKATEM AKREDYTACJI LABORATORIUM BADAWCZEGO nr L 106/1/97.

Badania prowadzono w 86 punktach pomiarowo-kontrolnych rozmieszczonych na 30 rzekach województwa i w 38 punktach na 10 zbiornikach zaporowych. W roku 1999 pobrano ogółem 1103 próby do analiz, z czego wykonano 31807 oznaczeń: fizyko-chemicznych, bakteriologicznych i hydrobiologicznych. Wyniki badań posłużyły do oceny stanu czystości wód, którą dla poszczególnych zlewni zaprezentowano w niniejszym opracowaniu.